![\"\"](\"https:\/\/candas365.es\/noticias\/wp-content\/uploads\/2018\/06\/Una-herramienta-computacional-permite-analizar-millones-de-celulas-a-la-vez-360x240.jpg\")
Todas las c\u00e9lulas del cuerpo humano comparten el mismo genoma, pero cada c\u00e9lula tiene el potencial de convertirse en un tejido o \u00f3rgano espec\u00edfico gracias a la expresi\u00f3n de los genes. Cient\u00edficos en todo el mundo intentan descubrir qu\u00e9 es lo que diferencia una c\u00e9lula de otra y uno de los mayores de retos de la investigaci\u00f3n gen\u00f3mica hoy en d\u00eda es analizar muchas c\u00e9lulas para poder encontrar e identificar estas diferencias.<\/p>\n
El an\u00e1lisis de c\u00e9lulas utilizando secuenciaci\u00f3n de ARN ha sido crucial para afrontar este reto y ha revolucionado nuestro conocimiento sobre la complejidad de los tejidos, los \u00f3rganos y los organismos. Estudiando la expresi\u00f3n de los genes en una misma c\u00e9lula, actualmente los cient\u00edficos son capaces de describir la heterogeneidad de una muestra con una resoluci\u00f3n sin precedentes y sin ning\u00fan conocimiento previo de su composici\u00f3n.<\/p>\n
En consecuencia, los proyectos a gran escala de c\u00e9lulas individuales han permitido identificar nuevos tipos de c\u00e9lulas hasta ahora desconocidos y crear nuevos mapas celulares detallados. En el marco del proyecto Human Cell Atlas (el atlas de las c\u00e9lulas humanas), los investigadores esperan poder crear un atlas de todos los tipos de c\u00e9lulas que forman el cuerpo humano. De todos modos, este tipo de proyectos generan enormes cantidades de datos gen\u00f3micos y analizarlos resulta unpo de sus principales retos.<\/p>\n
Una investigaci\u00f3n liderada por Holger Heyn en el Centro Nacional de An\u00e1lisis Gen\u00f3mico del Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CNAG-CRG), en colaboraci\u00f3n con investigadores de la Universidad Pompeu Fabra (UPF) y el Consorcio de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica en Red de Enfermedades Raras (CIBERER), presenta un sofisticado marco computacional para analizar los niveles de expresi\u00f3n de las c\u00e9lulas una a una, que permite procesar millones de c\u00e9lulas al mismo tiempo. El grupo ha comprobado el potencial de su herramienta procesando uno de los mayores estudios de c\u00e9lulas, y han analizado 1,3 millones de c\u00e9lulas del desarrollo del cerebro en ratones.<\/p>\n
\u201cBigSCale es extremadamente poderosa analizando genes espec\u00edficos de cada tipo celular, lo que resulta realmente \u00fatil en la posterior interpretaci\u00f3n de los datos del experimento\u201d, afirma Holger Heyn, jefe de equipo del CNAG-CRG y autor principal del estudio publicado en Genome Research. La novedad de esta herramienta anal\u00edtica llamada BigSCale reside en un modelo num\u00e9rico que determina con gran sensibilidad las diferencias entre c\u00e9lulas.<\/p>\n
Trazar las diferencias entre c\u00e9lulas<\/strong><\/p>\n Una vez trazadas las diferencias entre c\u00e9lulas, se pueden agrupar en poblaciones de c\u00e9lulas para describir la complejidad celular en un tejido. Como se supone que todos los tejidos est\u00e1n formados por diferentes tipos y subtipos celulares, un an\u00e1lisis de estas caracter\u00edsticas permite guiar una caracterizaci\u00f3n en profundidad y sin sesgos, y sin ninguna hip\u00f3tesis inicial de los tipos de c\u00e9lulas que se encontrar\u00e1n. Los genes que se expresen de forma distinta en una misma subpoblaci\u00f3n ayudan al investigador a agrupar c\u00e9lulas y a conocer mejor la anatom\u00eda de un tejido o a describir las funciones de nuevos tipos celulares.<\/p>\n Adem\u00e1s, la herramienta se dise\u00f1\u00f3 para afrontar retos futuros de grandes conjuntos de datos. \u201cLos costes para conseguir perfiles gen\u00e9ticos de cada c\u00e9lula est\u00e1n disminuyendo y estamos viendo que los estudios incrementan pues el n\u00famero de c\u00e9lulas a estudiar\u201d a\u00f1ade el Dr. Heyn. As\u00ed, un m\u00f3dulo de BigSCale permite el an\u00e1lisis de millones de c\u00e9lulas mediante una estrategia de circunvoluci\u00f3n. En BigSCale, los transcriptomas (informaci\u00f3n sobre el genoma funcional) de cada una de las c\u00e9lulas, se agrupa, lo que reduce la gran cantidad de datos que se procesan.<\/p>\n Con esta nueva herramienta el grupo analiz\u00f3 uno de los mayores conjuntos de datos sobre expresi\u00f3n g\u00e9nica formado por 1,3 millones de c\u00e9lulas, datos disponibles sobre las c\u00e9lulas del desarrollo del cerebro en ratones en 10x Genomics. \u201cBigSCale nos permiti\u00f3 profundizar en el proceso del desarrollo del cerebro de rat\u00f3n y caracterizar sus tipos celulares, e incluso describir tipos celulares neuronales poco frecuentes\u201d, comenta Giovanni Iacono, el primer autor del trabajo.<\/p>\n En concreto, el gran n\u00famero de c\u00e9lulas permiti\u00f3 que los investigadores pudieran centrarse en una peque\u00f1a poblaci\u00f3n de c\u00e9lulas transitoria, las llamadas c\u00e9lulas de Cajal-Retzius, y describir subestructuras importantes relacionadas con estadios de diferenciaci\u00f3n, organizaci\u00f3n espacial y funci\u00f3n celular. \u201cBigSCale ofrece una soluci\u00f3n muy potente para cualquier especie y es tambi\u00e9n aplicable fuera del contexto de secuenciaci\u00f3n de ARN\u201d, explica Heyn, y a\u00f1ade: \u201cEsperamos que pueda contribuir a la interpretaci\u00f3n de estudios a gran escala como el proyecto Human Cell Atlas\u201d.<\/p>\n SINC<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Todas las c\u00e9lulas del cuerpo humano comparten el mismo genoma, pero cada c\u00e9lula tiene el potencial de convertirse en un tejido o \u00f3rgano espec\u00edfico gracias a la expresi\u00f3n de los genes. Cient\u00edficos en todo el mundo intentan descubrir qu\u00e9 es lo que diferencia una c\u00e9lula de otra y uno de los mayores de retos de<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":98210,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[143],"tags":[],"class_list":{"0":"post-98209","1":"post","2":"type-post","3":"status-publish","4":"format-standard","5":"has-post-thumbnail","7":"category-sociedad"},"aioseo_notices":[],"aioseo_head":"\n\t\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t