![\"\"](\"https:\/\/candas365.es\/noticias\/wp-content\/uploads\/2017\/06\/Que-necesita-una-bacteria-para-infectar-a-otro-organismo-360x262.jpg\")
Cient\u00edficos del Centro de Biotecnolog\u00eda y Gen\u00f3mica de Plantas, centro mixto de la Universidad Polit\u00e9cnica de Madrid (UPM) y el Instituto Nacional de Investigaci\u00f3n y Tecnolog\u00eda Agraria y Alimentaria (INIA), han creado una herramienta inform\u00e1tica capaz de identificar de forma autom\u00e1tica factores de patogenicidad conocidos.<\/p>\n
Dicha herramienta puede utilizarse on line y proporciona un cat\u00e1logo instant\u00e1neo de las \u2018armas\u2019 de las que dispone la bacteria. Con estos datos, el equipo de investigadores construy\u00f3 un predictor que puede distinguir los genomas de las bacterias pat\u00f3genas de las no-pat\u00f3genas con una precisi\u00f3n superior al 90%.<\/p>\n
La aparici\u00f3n de nuevas enfermedades bacterianas asociadas al consumo de plantas, como la epidemia de Escherichia coli en Alemania en 2011, hace necesario un m\u00e9todo que permita predecir el origen de la bacteria a partir de los datos de su genoma.<\/p>\n
Para bien o para mal, las bacterias dominan el mundo. La inmensa mayor\u00eda son inocuas o beneficiosas y sin ellas ser\u00eda imposible la vida en la Tierra. Pero un peque\u00f1o n\u00famero de especies bacterianas son capaces de infectar a otros organismos produciendo enfermedades.<\/p>\n
Las bacterias pat\u00f3genas de plantas producen p\u00e9rdidas importantes en cosechas y, m\u00e1s importante a\u00fan, algunos pat\u00f3genos humanos se asocian a las plantas en algunas fases de su ciclo vital.<\/p>\n
La aparici\u00f3n de nuevas enfermedades bacterianas asociadas al consumo de plantas hace necesario un m\u00e9todo para predecir el origen de la bacteria a partir de su genoma<\/em><\/strong><\/p><\/blockquote>\n
Pero, \u00bfqu\u00e9 necesita una bacteria para infectar a otro organismo? Tradicionalmente los microbi\u00f3logos intentaban contestar a esta pregunta desactivando un gen particular de la bacteria y midiendo despu\u00e9s su capacidad infectiva.<\/p>\n
Esta estrategia ha resultado muy efectiva pero tiene limitaciones, ya que ha permitido identificar muchos de los mecanismos importantes pero no nos proporciona una perspectiva global.<\/p>\n
Genes necesarios para la infecci\u00f3n<\/strong><\/p>\n
Desde hace poco tiempo est\u00e1n disponibles los genomas secuenciados de un gran n\u00famero de bacterias \u2013pat\u00f3genas y no pat\u00f3genas\u2013, lo que facilita abordar la cuesti\u00f3n desde un nuevo punto de vista, qu\u00e9 genes debe contener un genoma bacteriano para que pueda infectar a una planta.<\/p>\n
As\u00ed, los autores han desarrollado una herramienta denominada PIFAR (Plant-bacteria Interaction Factors Resource) que consiste en un repositorio p\u00fablico de determinantes gen\u00e9ticos bacterianos implicados en la interacci\u00f3n planta-bacteria.<\/p>\n
El uso de esta herramienta ha permitido predecir posibles interacciones entre bacterias y plantas, algunas de las cuales eran ya conocidas y otras no. Por ejemplo, el g\u00e9nero Cronobacter incluye algunos pat\u00f3genos oportunistas, transmitidos por alimentos, que causan enfermedades graves en beb\u00e9s y neonatos y que pueden colonizar tambi\u00e9n vegetales.<\/p>\n
De manera consistente con estos resultados, los \u00edndices de asociaci\u00f3n con plantas que arroja el clasificador son altos, destacando la cepa Cronobacter turicencis, que da un valor m\u00e1s alto y que es particularmente perniciosa.<\/p>\n
Como explica Pablo Rodr\u00edguez Palenzuela, uno de los investigadores que ha llevado a cabo este trabajo, \u201clos avances en gen\u00f3mica permiten obtener la secuencia completa de cualquier especie bacteriana con facilidad. Por tanto, esta herramienta puede predecir si una bacteria implicada en una epidemia de nueva aparici\u00f3n tiene posiblemente un origen vegetal o no, lo cual proporcionar\u00eda una pista importante a los epidemi\u00f3logos para el control de dicha epidemia\u201d.<\/p>\n
SINC<\/p>\n
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