{"id":35701,"date":"2016-11-07T19:09:58","date_gmt":"2016-11-07T19:09:58","guid":{"rendered":"http:\/\/candas365.es\/noticias\/?p=35701"},"modified":"2016-11-07T19:09:58","modified_gmt":"2016-11-07T19:09:58","slug":"desarrollan-un-software-de-genomica-ambiental-comparativa-en-tiempo-real","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/candas365.es\/noticias\/desarrollan-un-software-de-genomica-ambiental-comparativa-en-tiempo-real\/","title":{"rendered":"Desarrollan un \u2018software\u2019 de gen\u00f3mica ambiental comparativa en tiempo real"},"content":{"rendered":"

\"desarrollan-un-software-de-genomica-ambiental-comparativa-en-tiempo-real_image_380\"Un equipo de Sequentia Biotech, con sede en el Parque Cient\u00edfico de Barcelona, ha desarrollado un software en la nube capaz de gestionar y analizar datos metagen\u00f3micos de cualquier comunidad microbiana generados por las tecnolog\u00edas de nueva secuenciaci\u00f3n (Next Generation Sequencing, NGS) aplicadas a la gen\u00e9tica humana, animal y vegetal.<\/p>\n

Seg\u00fan los autores, Gaia es la primera herramienta bioinform\u00e1tica que integra autom\u00e1ticamente todos los niveles de la clasificaci\u00f3n taxon\u00f2mica con la funcional (desde el reino hasta la subespecie) en tan s\u00f3lo 12 horas y permite comparar las muestras en tiempo real. Gaia es una plataforma cloud computing que se distribuye en la modalidad SaaS (Software as a Service) \u2013basada en la facturaci\u00f3n por el consumo\u2013 y es muy intuitiva; cualquier investigador aunque no sea experto en bioinform\u00e0tica la puede utilizar y evaluar f\u00e1cilmente el an\u00e1lisis de los resultados obtenidos.<\/p>\n

Funci\u00f3n de los genes microbianos<\/strong><\/p>\n

La metagen\u00f3mica (gen\u00f3mica ambiental o gen\u00f3mica de comunidades) es el an\u00e1lisis del metagenoma: el conjunto del ADN de los diversos microorganismos presentes en un h\u00e1bitat. Se trata de un campo nuevo de la gen\u00f3mica que busca obtener y analizar mediante tecnolog\u00edas NGS (Next Generation Sequencing) secuencias del genoma de los diferentes microorganismos que componen una comunidad sin la necesidad de aislarlos o cultivarlos in vitro, lo que permite obtener informaci\u00f3n, no s\u00f3lo de la estructura de la comunidad (diversidad, distribuci\u00f3n, etc.), sino tambi\u00e9n de la funci\u00f3n de los genes microbianos que la componen.<\/p>\n

Es capaz de obtener una visi\u00f3n completa y detallada del microbioma de diferentes ambientes del cuerpo humano<\/em><\/strong><\/p><\/blockquote>\n

Gaia pretende dar respuesta a este desaf\u00edo de la bioinform\u00e1tica. Se trata de una herramienta on line capaz de obtener una visi\u00f3n completa y detallada del microbioma de diferentes ambientes procedentes del cuerpo humano, (est\u00f3mago, boca, piel etc.), animales, residuos org\u00e1nicos, agricultura, y medio ambiente (tierra, agua, etc.).<\/p>\n

\u201cSe trata de una herramienta que proporciona an\u00e1lisis de datos metagen\u00f3micos a partir de muestras ambientales, lo que constituye una gran ventaja, ya que se estima que con los m\u00e9todos tradicionales, basados en el aislamiento y cultivo de microorganismos in vitro, se pierden entre 90% y el 99% de los microbios de la muestra\u201d, explica Walter Sanseverino, consejero delegado de Sequentia.<\/p>\n

Adem\u00e1s, trabaja con cualquier organismo (eucariotas, procariotas y virus), frente a la mayor\u00eda de los sistemas bioinform\u00e1ticos actuales que solo trabajan a nivel de bacterias.<\/p>\n

SINC<\/p>\n

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