![\"una-aplicacion-permite-estudiar-la-diversidad-genetica-a-lo-largo-de-todo-el-genoma_image_380\"](\"https:\/\/candas365.es\/noticias\/wp-content\/uploads\/2016\/10\/Una-aplicacion-permite-estudiar-la-diversidad-genetica-a-lo-largo-de-todo-el-genoma_image_380-360x233.jpg\")
Facilitar la identificaci\u00f3n y selecci\u00f3n de marcadores moleculares distribuidos a lo largo del genoma de organismos modelo y no modelo es una de las principales aplicaciones de DOMINO (Development Of Molecular markers In Non-model Organisms), una innovadora herramienta bioinform\u00e1tica presentada en un estudio publicado en la revista Bioinformatics.<\/p>\n
\u00abTener la posibilidad de identificar nuevos marcadores o seleccionar los m\u00e1s adecuados entre un conjunto de marcadores existentes es un paso previo en el trabajo cient\u00edfico de muchos investigadores, como por ejemplo en los estudios de filogen\u00f3mica o filogeograf\u00eda molecular que usan datos de secuenciaci\u00f3n masiva del ADN, conocidos como datos de secuenciaci\u00f3n de nueva generaci\u00f3n (NGS). De hecho, hoy en d\u00eda, disponer de muchos marcadores moleculares se convierte en un aut\u00e9ntico cuello de botella en muchas investigaciones\u00bb, explica el catedr\u00e1tico Julio Rozas, que lidera el Grupo de Investigaci\u00f3n en Gen\u00f3mica Evolutiva y Bioinform\u00e1tica de la Universidad de Barcelona, equipo integrante de la plataforma Bioinformatics Barcelona (BIB).<\/p>\n
DOMINO es una aplicaci\u00f3n bioinform\u00e1tica muy \u00fatil para investigadores que usan tanto organismos modelo como no modelo<\/strong><\/p><\/blockquote>\n
Rozas detalla que DOMINO es una aplicaci\u00f3n bioinform\u00e1tica muy \u00fatil para investigadores que usan tanto organismos modelo como no modelo. \u00abSin embargo, los organismos no modelo muestran m\u00e1s dificultades para el desarrollo de marcadores moleculares, ya que como su secuencia gen\u00f3mica no es conocida, resulta mucho m\u00e1s dif\u00edcil disponer de un n\u00famero suficiente de estos marcadores\u00bb, a\u00f1ade.<\/p>\n
De la filogenia molecular y la filogen\u00f3mica a la gen\u00f3mica de poblaciones<\/strong><\/p>\n
En comparaci\u00f3n con otros softwares inform\u00e1ticos, DOMINO combina una alta flexibilidad \u2013permite la utilizaci\u00f3n del software con una gran diversidad de tipos de datos de NGS\u2013 con la facilidad de uso mediante una interfaz gr\u00e1fica de usuario (GUI) para que el software pueda ser empleado por investigadores sin grandes conocimientos bioinform\u00e1ticos.<\/p>\n
DOMINO es una herramienta inform\u00e1tica de inter\u00e9s potencial para impulsar las investigaciones en el campo de la filogenia molecular y la filogen\u00f3mica (estudio de las relaciones evolutivas de varias especies cercanas), la filogeograf\u00eda (los factores demogr\u00e1ficos y selectivos responsables de la distribuci\u00f3n actual de las especies), y la gen\u00e9tica y gen\u00f3mica de poblaciones (determinaci\u00f3n de los genes y las regiones gen\u00f3micas afectados por diferentes mecanismos evolutivos, incluyendo los procesos demogr\u00e1ficos y selectivos).<\/p>\n
El trabajo cient\u00edfico para desarrollar DOMINO, que ha sido coordinado por los profesores Julio Rozas, Miquel A. Arnedo y Alejandro S\u00e1nchez, constata una vez m\u00e1s la necesidad de desarrollar aplicaciones bioinform\u00e1ticas vers\u00e1tiles que puedan adaptarse a la gran velocidad con que progresan las tecnolog\u00edas de secuenciaci\u00f3n del ADN y su aplicaci\u00f3n en estudios evolutivos.<\/p>\n
\u00abEn el futuro, esperamos que DOMINO tambi\u00e9n pueda emplear datos de NGS de nuevas tecnolog\u00edas \u2013actualmente utiliza secuencias de ADN de plataformas como 454 o Illumina\u2013, adem\u00e1s de trabajar con informaci\u00f3n proporcionada por nuevas aplicaciones experimentales, derivadas de los llamados RADSeq o de otras estrategias basadas en la secuenciaci\u00f3n de una parte representativa del genoma\u00bb, indica Rozas, primer autor de otro art\u00edculo publicado en 2003 en la revista Bioinformatics sobre un potente software bioinform\u00e1tico para analizar los polimorfismos del ADN, que fue el trabajo m\u00e1s citado en toda Espa\u00f1a \u2013con 1.815 citas\u2013 durante el periodo 1999-2009, seg\u00fan datos de Essential Science Indicators.<\/p>\n
SINC<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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